La ACOT fue fundada el 7 de junio de 1961 en la sala de sesiones del Hospital San Juan de Dios, en donde se creó la 1er. Acta y la 1era. Junta Directiva
La Asociación Costarricense de Ortopedia y Traumatología fue constituida por la ley de Asociaciones el 24 de septiembre de 1981.
En el 2001 se revisaron y aprobaron los nuevos estatutos.